测序技术能否替代BAC文库

        

如今测序技术越来越普及,也是帮人们解决了测序方面的许多难题,大大推进了基因研究方面的发展。但同样基于其工作原理,二代测序技术也有着其无法突破的瓶颈。众所周知,二代测序的主流测序仪的读长都很短,一般都只有几十bp到几百bp之间,读长300bp及以上的就非常少见了。正是由于这个原因,当二代测序遇到高度重复的保守序列时,就无法完成序列组装和拼接任务,也就无法获得完整的连续的基因组序列。


而我们知道,真核生物一般都含有多个保守序列的;所以目前在真核生物基因研究中,二代测序技术更多地运用在转录组或其他短序列测序研究上,而在基因组序列研究中,更多地是在构建BAC等其他基因组文库的基础上再研究的。一般情况下,BAC文库的插入片段都会≥100kb,有的甚至可以达到200kb甚至更长;这么长的插入片段几乎可以包含真核生物中所有的保守序列,这样也就可以拿到完整的连续的基因组序列。


在实际工作中我们有好几个客户都是有类似的情况,起初客人也是想通过测序来达到实验目的,但当测序结果回来后还是达不到要求。经过一番周折后还是找到我们公司来构建BAC文库,文库完成后发现实验效果很好。