BAC文库的优势及其应用


BAC文库的优势

对于许多大规模的基因组研究如基因组测序,物理图谱构建,基因克隆等来说,BAC文本库是其必备的一个基本要素。BAC克隆技术的出现大约在1990年前后,随后迅速获得普及并十分流行。这种技术主要被用于基因组分析如大规模的基因组物理图谱绘制和大规模基因组测序等,因此,尽管出现的比YAC、cosmid等克隆技术晚,但由于其明显的技术优势,仍迅速超越YAC、cosmid等克隆技术,成为当前最受欢迎的基因组克隆技术。相较于YAC和cosmid克隆技术,我们的BAC克隆技术具有以下优势:

❉ 相较于cosmid和其他plasmid体系,其具有更大的插入片段(可高达300kb)。

❉ 稳定性远远强于酵母菌。

❉  相较于YAC克隆,BAC克隆的增殖速度更快;

❉  处理起来更方便,质粒DNA提取也更容易;

❉  我们拥有十分丰富的处理高GC含量或海洋细菌的经验;

❉  我们拥有更高效的杂交或PCR筛选方法和经验,

❉  我们也拥有足够的经验将产品运送到世界各地。

BAC文库的应用  

构建BAC文库的主要用途是大规模物理图谱绘制和基因组测序,但还有其他的一些研究也可以用到BAC文库:

分离完整代谢途径的基因簇

一个BAC文库可以用于来扫描基因途径以便发现新的药物,可以用于扫描各种疾病的基因途径,微生物代谢途径和植物遗传学等等。同样,BAC文库还可以用于其他方面,例如BAC宏阵列,通过对文库PCR筛选进行基因分离,制造各种DNA探针用于同源性的杂交。

制备荧光原位杂交探针

BAC载体可以作为荧光原位杂交(FISH)中荧光探针,用于组织样本的定位和分析,以达到了解染色体重排,扩增,缺失等的具体情况。通常情况下,针对染色体的特定部位的荧光探针来标记单个细胞样品中染色体的位点,以便发现指定的遗传序列。

可作为使用二元载体的植物的基于图谱的基因克隆的互补

BAC文库可以植物基因组的遗传结构查询以及使用互补技术的突变基因型分析。这为科研工作者提供了一个可靠的植物基因表达和单个基因分离的研究工具。

基因组步移

文库可以直接用于基因组测序并且允许在研究基因结构时使用整个基因组,而不需要直接从基因组测序,直接从基因组测序是个非常难的问题。